一、原位雜交儀應用 ①細胞特異性mRNA轉錄的定位，可用于基因圖譜，基因表達和基因組進化的研究；②感染組織中病毒DNA/RNA的檢測和定位，如EB病毒mRNA、人類乳頭狀瘤病毒和巨細胞病毒DNA的檢測；
③癌基因、抑癌基因及各種功能基因在轉錄水平的表達及其變化的檢測；
④基因在染色體上的定位；
⑤檢測染色體的變化，如染色體數量異常和染色體易位等；
⑥分裂間期細胞遺傳學的研究，如遺傳病的產前診斷和某些遺傳病基因攜帶者的確定，某些腫瘤的診斷和生物學劑量測定等。
二、注意事項
1、固定液的選擇及固定時間 石蠟組織建議用10%中性緩沖福爾馬林固定6～48h，其它固定液對實驗結果可能產生一定的影響。 組織離體后應盡快固定，建議在標本離體后30min內固定。如樣本固定不及時，熒光信號會減弱。 固定液的體積是組織體積的4～20倍，否則固定不充分，容易出現無信號或者信號很弱的現象。 而且，為了保證信號的準確性，蠟塊最好在2年內進行檢測，已經切好的切片在6周內檢測最佳。
2、組織切片和載玻片的選擇 組織切片4～5μm 厚，過厚或過薄的切片均會對信號的強弱產生影響，而且切片應完整，質量良好，否則會在預處理時掉片。 載玻片的選擇建議使用防脫載玻片，有條件的實驗室可使用更好的陽離子或者陰離子專用載玻片，可有效防止脫片現象的發生。
